MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 5601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021081	ACCC	2	8	1745492	1745499	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3502	NC_021081	GTTGA	2	10	1745530	1745539	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_021081	TG	3	6	1747345	1747350	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_021081	T	7	7	1747426	1747432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_021081	ATC	2	6	1747480	1747485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_021081	GCG	2	6	1750964	1750969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_021081	GGCC	2	8	1754049	1754056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3508	NC_021081	TAG	2	6	1755034	1755039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_021081	ACG	2	6	1755132	1755137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_021081	AGC	2	6	1755556	1755561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_021081	CTG	2	6	1755633	1755638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_021081	GGGCT	2	10	1756449	1756458	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3513	NC_021081	GGC	2	6	1758825	1758830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_021081	GGT	2	6	1760528	1760533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_021081	GCGCA	2	10	1760543	1760552	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3516	NC_021081	AGC	2	6	1761193	1761198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_021081	CGC	2	6	1761246	1761251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_021081	GCC	2	6	1761262	1761267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3519	NC_021081	TCC	2	6	1761330	1761335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_021081	CGCTA	2	10	1761339	1761348	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3521	NC_021081	GGC	2	6	1761539	1761544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_021081	GCC	2	6	1761621	1761626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_021081	CAGCC	2	10	1761632	1761641	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3524	NC_021081	CAA	2	6	1761678	1761683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_021081	CT	3	6	1761773	1761778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_021081	GC	3	6	1761852	1761857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3527	NC_021081	GGT	2	6	1762051	1762056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_021081	TTA	2	6	1762125	1762130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_021081	GCG	2	6	1762196	1762201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_021081	CGCT	2	8	1762262	1762269	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_021081	CGC	2	6	1762277	1762282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_021081	GT	4	8	1762283	1762290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_021081	CTC	2	6	1762649	1762654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_021081	GCGT	2	8	1762779	1762786	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3535	NC_021081	C	6	6	1762820	1762825	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3536	NC_021081	A	7	7	1762826	1762832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_021081	C	6	6	1762912	1762917	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3538	NC_021081	CAG	2	6	1763673	1763678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3540	NC_021081	TTAT	2	8	1765928	1765935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_021081	TAT	2	6	1767342	1767347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_021081	CTTT	2	8	1767394	1767401	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3543	NC_021081	GCG	2	6	1767405	1767410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_021081	AGG	2	6	1767434	1767439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_021081	CTG	2	6	1770161	1770166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_021081	A	6	6	1771403	1771408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_021081	CAG	2	6	1777670	1777675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_021081	GCT	2	6	1777733	1777738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_021081	GGA	2	6	1777745	1777750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_021081	CCCGG	2	10	1779252	1779261	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3551	NC_021081	ATC	2	6	1784034	1784039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_021081	TTGGG	2	10	1784057	1784066	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_021081	ACGC	2	8	1784094	1784101	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3554	NC_021081	CGC	2	6	1784144	1784149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3557	NC_021081	CAG	2	6	1784230	1784235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_021081	GGGGTG	2	12	1784242	1784253	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_021081	C	6	6	1784340	1784345	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3560	NC_021081	GGGT	2	8	1784367	1784374	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_021081	ACC	2	6	1784440	1784445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_021081	GTTGT	2	10	1784538	1784547	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_021081	GC	4	8	1785665	1785672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3564	NC_021081	TGA	2	6	1787460	1787465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_021081	T	6	6	1787473	1787478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_021081	CA	3	6	1787481	1787486	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3567	NC_021081	AAACTG	2	12	1787496	1787507	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3568	NC_021081	GAT	2	6	1788878	1788883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_021081	A	7	7	1788893	1788899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_021081	CA	3	6	1788954	1788959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3571	NC_021081	GCGG	2	8	1788964	1788971	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3572	NC_021081	T	8	8	1788972	1788979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_021081	AGG	2	6	1790270	1790275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_021081	A	6	6	1790300	1790305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_021081	GCCG	2	8	1790320	1790327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3576	NC_021081	CGA	2	6	1792361	1792366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3578	NC_021081	T	6	6	1792592	1792597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_021081	ATG	2	6	1795054	1795059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_021081	TGC	2	6	1797741	1797746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_021081	GC	3	6	1797752	1797757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3582	NC_021081	CGG	2	6	1797766	1797771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_021081	TGG	2	6	1797941	1797946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_021081	TGG	2	6	1797954	1797959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3587	NC_021081	TCGG	2	8	1799530	1799537	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3588	NC_021081	GAGG	2	8	1804695	1804702	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_021081	AGG	2	6	1804883	1804888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_021081	TGG	2	6	1807984	1807989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3592	NC_021081	GCT	2	6	1808133	1808138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_021081	CCCA	2	8	1808282	1808289	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3594	NC_021081	C	6	6	1808331	1808336	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3595	NC_021081	A	6	6	1808352	1808357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_021081	GTC	2	6	1808399	1808404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_021081	TGG	2	6	1808463	1808468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_021081	GGGCA	2	10	1808477	1808486	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3599	NC_021081	AAT	3	9	1808510	1808518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_021081	CTCG	2	8	1808521	1808528	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3601	NC_021081	AGG	2	6	1808651	1808656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_021081	AAG	2	6	1808733	1808738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_021081	ACGA	2	8	1808762	1808769	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3604	NC_021081	GCC	2	6	1808805	1808810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_021081	CTG	2	6	1808818	1808823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_021081	G	6	6	1808840	1808845	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_021081	AGC	2	6	1808894	1808899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_021081	GCT	2	6	1808936	1808941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_021081	CTT	2	6	1809142	1809147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_021081	CCA	2	6	1809745	1809750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3611	NC_021081	ATT	2	6	1811475	1811480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3613	NC_021081	T	7	7	1814616	1814622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_021081	TGG	2	6	1814671	1814676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_021081	CAAT	2	8	1815306	1815313	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3616	NC_021081	TC	3	6	1817326	1817331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3617	NC_021081	C	7	7	1817406	1817412	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3618	NC_021081	GC	3	6	1818557	1818562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3619	NC_021081	TCC	2	6	1820561	1820566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3620	NC_021081	CA	3	6	1822302	1822307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3621	NC_021081	ATAC	2	8	1822364	1822371	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3622	NC_021081	GCA	2	6	1822373	1822378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_021081	CCG	2	6	1822456	1822461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_021081	TGC	2	6	1822496	1822501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_021081	GC	3	6	1822521	1822526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3626	NC_021081	GCG	2	6	1824428	1824433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_021081	TA	3	6	1829107	1829112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_021081	TTG	2	6	1829174	1829179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_021081	GGC	2	6	1829207	1829212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_021081	A	6	6	1829225	1829230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3632	NC_021081	ATC	2	6	1837058	1837063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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